Cosa succede in Assassins Creed 2?

Nel tentativo di contrastare l'Abstergo ei Templari moderni, Desmond usa un nuovo Animus per rivivere i ricordi genetici di suo antenato, Ezio Auditore da Firenze, che visse in Italia durante il Rinascimento. Il giocatore controlla Desmond in una certa misura, ma principalmente Ezio, che diventa un assassino dopo che la sua famiglia è stata tradita.